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CPE / Serror

 

Commensalisme et Pathogénie des entérocoques

Responsable : Pascale Serror


AXES DE RECHERCHE ET PROJETS EN COURS


Le microbiote intestinal forme un écosystème en équilibre composé d’environ 1014 bactéries réparties en plus de 1000 espèces. Il exerce un rôle de première importance sur l’organisme : métabolique, trophique et de protection contre la colonisation du tube digestif par des microorganismes pathogènes. Si son importance en santé humaine a été démontrée, il est également considéré comme un réservoir de pathogènes opportunistes dont notre mode de vie pourrait faciliter l’émergence. Enterococcus faecalis est une bactérie commensale à Gram positif présente dans le tube digestif de l’homme et de nombreux animaux. Chez l’homme, E. faecalis est l’une des premières bactéries à coloniser le tractus gastro-intestinal dans les heures qui suivent la naissance et demeure dans l’intestin à un niveau sous-dominant (< 108bactéries/g de matières fécales) le restant de notre vie.  Inoffensive chez l'homme sain, E. faecalis est aussi considérée comme un agent pathogène opportuniste. Elle représente une cause majeure d'infections nosocomiales très fréquemment associées à un dérèglement du microbiote.

Les recherches de l’équipe CPE portent sur l’étude de la pathogénie d’E. faecalis dans le contexte du microbiote intestinal. Notre objectif est de comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires qui permettent à E. faecalis d’adopter un mode de vie commensal ou pathogène chez l’homme. Nous avons identifié plusieurs gènes d’E. faecalis qui codent des facteurs de colonisation et de virulence. Nos recherches actuelles portent sur le fonctionnement de ces gènes, sur la compréhension des cascades de régulation qui coordonnent leur expression et sur l’analyse de la réponse de l’hôte au cours de l’infection. Nos études se fondent sur des approches de génomique comparative, de génétique et/ou globales (RNA seq), combinées à l’utilisation de modèles cellulaires et animaux.



1. Interaction d’E. faecalis avec l’hôte

·   Colonisation: Facteurs d’adaptation au tractus intestinal (L. Rigottier-Gois).

Le criblage d’une banque mutants (Rigottier-Gois et al., 2011) dans un modèle de colonisation intestinale chez la souris a conduit à l’identification de gènes impliqués dans la colonisation du tractus gastro-intestinal. Nous étudions l’impact du rhamnopolysaccharide de surface dans l’adaptation d’E. faecalis au tractus gastro-intestinal.



·  Translocation: Cible(s) cellulaires et réponse immunitaire mucosale (C. Archambaud et L. Rigottier-Gois)

Nous déterminons les types cellulaires qui permettent à E. faecalis de traverser la barrière intestinale et caractérisons les événements moléculaires et cellulaires au cours de la réponse immunitaire mucosale contre E. faecalis

·  Virulence: Aspects mécanistiques

          i. Rôle d’ElrA dans la virulence d’E. faecalis (C. Archambaud et P. Serror)

La proteine ElrA (Enterococcal Leucin-Rich Protein A) est un facteur de virulence de la famille des internalines (Brinster et al., 2007). Nous analysons le rôle d’ElrA et de l’opéron elr dans les interactions entre E. faecalis et l’hôte.          ii. Role des prophages (R. Matos)

La caractérisation de 6 prophages d’une souche clinique a révélé pour la première fois un lien direct entre les prophages et l’adhésion d’ E. faecalis aux plaquettes sanguines humaines constituant une première étape de l'endocardite infectieuse (Matos et al., 2013). Nous poursuivons l’étude du rôle des prophages dans le processus infectieux d’E. faecalis.

 ·  Prévention : Impact de bactéries probiotiques sur l’étape de translocation intestinale (L. Crouzet et L. Rigottier-Gois)

Nous analysons l’impact de bactéries probiotiques sur une dysbiose intestinale causée par un traitement antibiotique. 

2. Cascades de régulation des effecteurs d’E. faecalis

·  Cascades transcriptionnelles et post-transcriptionnelles (C. Lacoux, F. Wessner et F. Repoila).

Le séquençage massif des ARNs étiquetés (Fouquier d’Hérouel et al., 2011) au cours d’une cinétique d’adaptation de la bactérie nous permet de déduire la régulation transcriptionnelle et post-transcriptionnelle. Cette même méthode est utilisée pour identifier les gènes d’un même régulon.


Adapted from Fouquier d’Hérouel A et al.Nucl. Acids Res. 2011;39:e46-e46


·  Protéines et ARNs régulateurs (S. Gaubert, F. Wessner et F. Repoila)

          i. Régulation d’elrA

L’expression du gène de virulence elrA est induite in vivo. Nous avons montré que le régulateur ElrR de la famille RNPP pour Rap/NprR/PlcR/PrgX active l’expression d’elrA (Dumoulin et al., 2013). Le signal d’activation d’ElrR et le mécanisme moléculaire d’activation de l’expression d’elrA sont en cours de caractérisation.

          ii. Régulation croisée toxine-antitoxine 

Les modules toxine-antitoxine (TA) permettent aux bactéries de survivre dans des conditions de stress. Nous avons révélé une organisation particulière de deux TA dans bon nombre de souches d’Efaecalis (> 30%, dont l’isolat pathogène V583). Cette organisation en antisense engendre une régulation croisée et complexe des deux modules, qui permet le maintien homéostatique de la quantité de chacune des toxines exprimées et accroit la souplesse adaptative de la bactérie.

Rédaction : Cristel ARCHAMBAUD
Date de création : 14 Avril 2011
Mise à jour : 05 Mars 2014
Contact :

Pascale Serror :
Institut Micalis (UMR1319/INRA-AgroParisTech)

I.N.R.A., Domaine de Vilvert

78352 Jouy en Josas Cedex, France

01.34.65.21.66