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Stagiaire Master 2 (Janvier - Juillet 2019)
Ingénieur d'étude (Août 2019 - Janvier 2020)

Après avoir obtenu mon Master 2 Génomique et Environnement à l'Université Paris-Saclay, je suis actuellement en première année de thèse CIFRE à l'école doctorale ABIES. Cette thèse CIFRE est co-financée par une bourse ANRT ainsi que par la start-up Biomathematica. Cette étude se positionne à l'interface de la microbiologie, de la bio-informatique et de modèles mathématiques. Le thème dominant de cette thèse est la dégradation des protéines alimentaires par le microbiote intestinal humain. Cette étude comporte deux aspects complémentaires, l'un à l’échelle de la bactérie et l'autre à l'échelle communautaire. La première partie consiste à modéliser l'impact de la dégradation de protéines par une souche de Bacteroides caccae, en analysant son métabolisme par le biais d'un modèle à flux balancé (FBA). Le second aspect consiste à étudier la distribution de l'expression des protéases au sein du microbiote intestinal humain par l'utilisation du principe de factorisation par matrice non négative dans l'objectif d'identifier des profils d'expression spécifiques à certaines conditions (maladies, régimes alimentaires).