Etienne Dervyn

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Pôle "Microbiologie des Systèmes et de Synthèse"
Systems Biology for bacterial Engineering and Redesign / Matthieu Jules
Membres SyBER
Etienne Dervyn

Etienne Dervyn

CR INRAE

Description du projet

Etienne Dervyn est Chargé de Recherche à l’INRA dans le groupe SyBER. Après des années à travailler sur la stabilité et la ségrégation du génome ses recherches actuelles portent sur la transcription globale du chromosome de Bacillus subtilis et sa régulation mais aussi sur la construction de souches minimales et de souches châssis.

Dr Dervyn a obtenu son doctorat de Génétique Cellulaire et Moléculaire de l’université de Paris XI à Orsay en 1992 au sein du laboratoire de Génétique microbienne à l’INRA de Jouy-en-Josas dans le cadre d’un contrat ASC (Attaché Scientifique Contractuel). Cette thèse a porté sur la recombinaison illégitime entre des courtes séquences répétées. Dr Dervyn a ensuite effectué un post doctorat à l’Institut Pasteur sur la régulation de l’expression des gènes de toxines de Bacillus thuringiensis, dans le laboratoire de Biochimie Microbienne sous la direction de George Rapoport et d’André Klier. En Août 1994 il a réussi le concours de Chargé de Recherche 2ème classe pour un poste dans le laboratoire de Génétique Microbienne dirigé par Dusko Ehrlich à l’INRA de Jouy en Josas. En 1998, Dr Dervyn a été promu Chargé de Recherche 1ère classe dans ce même laboratoire dans l’équipe de Philippe Noirot. Il a soutenu sa HDR en septembre 2009 et a intégré l’Institut Micalis (UMR1319-AgroParisTech) à sa création en 2010.

 

Dr Dervyn a travaillé récemment sur la transcription chez Bacillus subtilis par des approches globales (dans le cadre d’un projet européen BaSysBio). En plus des questions fondamentales sur l’organisation la ségrégation du chromosome de cet organisme, ses compétences sur la modification du génome de cette organisme l’on amené dans le cadre de la biologie de synthèse à travailler sur la réduction du génome de B. subtilis (dans le cadre d’un projet européen BaSynThec.) et sur la construction de souches châssis (dans le cadre d’un projet financé par TWB).

 

Dr Dervyn a publié un total de 25 articles depuis 2004 (h-index 19 Web of Science).

Sélection de 6 publications récentes (la liste complète est accessible ci-dessous):

* Equal contributors, § Corresponding authors

1: Benoist C, Guérin C, Noirot P,Dervyn E§. Constitutive Stringent Response Restores Viability of Bacillus subtilis Lacking Structural Maintenance of Chromosome Protein. PLoS One. 2015 Nov 5;10(11):e0142308. doi:10.1371/journal.pone.0142308. eCollection 2015. PubMed PMID: 26539825; PubMed Central PMCID: PMC4634966.

2: Rochat T, Delumeau O, Figueroa-Bossi N, Noirot P, Bossi L, Dervyn E, Bouloc P. Tracking the Elusive Function of Bacillus subtilis Hfq. PLoS One. 2015 Apr 27;10(4):e0124977. doi: 10.1371/journal.pone.0124977. eCollection 2015. PubMed PMID: 25915524; PubMed Central PMCID: PMC4410918.

3: Nicolas P*, Mäder U*, Dervyn E*, Rochat T, Leduc A, Pigeonneau N, Bidnenko E, Marchadier E, Hoebeke M, Aymerich S, Becher D, Bisicchia P, Botella E, Delumeau O, Doherty G, Denham EL, Fogg MJ, Fromion V, Goelzer A, Hansen A, Härtig E, Harwood CR, Homuth G, Jarmer H, Jules M, Klipp E, Le Chat L, Lecointe F, Lewis P, Liebermeister W, March A, Mars RA, Nannapaneni P, Noone D, Pohl S, Rinn B, Rügheimer F, Sappa PK, Samson F, Schaffer M, Schwikowski B, Steil L, Stülke J, Wiegert T, Devine KM, Wilkinson AJ, van Dijl JM, Hecker M, Völker U, Bessières P, Noirot P. Condition-dependent transcriptome reveals high-level regulatory architecture in Bacillus subtilis. Science. 2012 Mar 2;335(6072):1103-6. doi: 10.1126/science.1206848. PubMed PMID: 22383849.

4: Fabret C, Dervyn E, Dalmais B, Guillot A, Marck C, Grosjean H, Noirot P. Life without the essential bacterial tRNA Ile2-lysidine synthetase TilS: a case of tRNA gene recruitment in Bacillus subtilis. Mol Microbiol. 2011 May;80(4):1062-74. doi: 10.1111/j.1365-2958.2011.07630.x. Epub 2011 Apr 5. PubMed PMID: 21435031.

5: Dervyn E, Noirot-Gros MF, Mervelet P, McGovern S, Ehrlich SD, Polard P, Noirot P. The bacterial condensin/cohesin-like protein complex acts in DNA repair and regulation of gene expression. Mol Microbiol. 2004 Mar;51(6):1629-40. PubMed PMID: 15009890.

6: Dervyn E, Suski C, Daniel R, Bruand C, Chapuis J, Errington J, Jannière L, Ehrlich SD. Two essential DNA polymerases at the bacterial replication fork.Science. 2001 Nov 23;294(5547):1716-9. PubMed PMID: 11721055.

Publications

9. FABRET, C., E. DERVYN, B. DALMAIS, A. GUILLOT, C. MARCK, H. GROSJEAN & P. NOIROT, (2011) Life without the essential bacterial tRNA Ile2-lysidine synthetase TilS: a case of tRNA gene recruitment in Bacillus subtilis. Mol Microbiol 80: 1062-1074.
8. PINCHUK, G. E., D. A. RODIONOV, C. YANG, X. LI, A. L. OSTERMAN, E. DERVYN, O. V. GEYDEBREKHT, S. B. REED, M. F. ROMINE, F. R. COLLART, J. H. SCOTT, J. K. FREDRIKSON & A. S. BELIAEV, (2009) Genomic reconstruction of Shewanella oneidensis MR-1 metabolism reveals a previously uncharacterized machinery for lactate utilization. Proc Natl Acad Sci U S A 106: 2874-2879.
7. RODIONOV, D. A., X. LI, I. A. RODIONOVA, C. YANG, L. SORCI, E. DERVYN, D. MARTYNOWSKI, H. ZHANG, M. S. GELFAND & A. L. OSTERMAN, (2008) Transcriptional regulation of NAD metabolism in bacteria: genomic reconstruction of NiaR (YrxA) regulon. Nucleic Acids Res 36: 2032-2046.
6. BRANDA, S. S., J. E. GONZALEZ-PASTOR, E. DERVYN, S. D. EHRLICH, R. LOSICK & R. KOLTER, (2004) Genes involved in formation of structured multicellular communities by Bacillus subtilis. J Bacteriol 186: 3970-3979.
5. DERVYN, E., M. F. NOIROT-GROS, P. MERVELET, S. McGOVERN, S. D. EHRLICH, P. POLARD & P. NOIROT, (2004) The bacterial condensin/cohesin-like protein complex acts in DNA repair and regulation of gene expression. Mol Microbiol 51: 1629-1640.
4. KOBAYASHI, K. et al. (2003) Essential Bacillus subtilis genes. Proc Natl Acad Sci U S A 100: 4678-4683.
3. NOIROT-GROS, M. F., E. DERVYN, L. J. WU, P. MERVELET, J. ERRINGTON, S. D. EHRLICH & P. NOIROT, (2002) An expanded view of bacterial DNA replication. Proc Natl Acad Sci U S A 99: 8342-8347.
2. SOPPA, J., K. KOBAYASHI, M. F. NOIROT-GROS, D. OESTERHELT, S. D. EHRLICH, E. DERVYN, N. OGASAWARA & S. MORYIA, (2002) Discovery of two novel families of proteins that are proposed to interact with prokaryotic SMC proteins, and characterization of the Bacillus subtilis family members ScpA and ScpB. Mol Microbiol 45: 59-71.
1. DERVYN, E., C. SUSKI, R. DANIEL, C. BRUAND, J. CHAPUIS, J. ERRINGTON, L. JANNIERE & S. D. EHRLICH, (2001) Two essential DNA polymerases at the bacterial replication fork. Science 294: 1716-1719.

Curriculum Vitae

J’ai effectué mon cursus universitaire (DEUG, Licence, Maitrise, DEA) dans les facultés de Lille et d’Orsay. Durant ma thèse j’ai travaille sur la recombinaison illégitime entre des courtes séquences répétées. En novembre 1992 j’ai obtenu le doctorat de Génétique Cellulaire et Moléculaire, de l’université de Paris XI, Orsay.
Après un post doctorat à l’Institut Pasteur sur la régulation de l’expression des gènes de toxine de Bacillus thuringiensis, j’ai réussi en Août 1994 le concours de Chargé de Recherche 2ème classe pour un poste dans le laboratoire de Génétique Microbienne dirigé par S.D. Ehrlich, à l’I.N.R.A. de Jouy en Josas.
En Août 1998 j’ai été promu Chargé de Recherche 1ème classe dans ce même laboratoire
J’ai soutenu ma HDR en septembre 2009.

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Date de modification : 14 septembre 2023 | Date de création : 23 janvier 2020 | Rédaction : Etienne Dervyn