Au cours de ma présentation, je parlerai des rôles fascinants des phages tempérés au sein du microbiote intestinal humain et dans des contextes écologiques plus larges.

 

Je présenterai la manière dont mon équipe et moi-même étudions systématiquement ces phages et leur réponse aux changements environnementaux tels que les antibiotiques, les modifications du régime alimentaire et la dysbiose, en combinant métagénomique, études de cohortes longitudinales et modèles intestinaux in vitro. De plus, un accent particulier sera mis sur un groupe peu étudié de phages tempérés, appelés phages-plasmides. Je présenterai nos travaux sur la cartographie de leur grande et fascinante diversité dans l’intestin (et au-delà), ainsi que l’examen de leur lien avec la dynamique de compétition chez le pathogène prioritaire Acinetobacter baumannii.

 

Enfin, je soulignerai comment nous développons de nouveaux outils informatiques et cadres de classification pour améliorer la précision de la (méta-)génomique des phages, et comment ceux-ci contribuent ultimement à comprendre le rôle des phages dans la stabilité du microbiote intestinal et la santé humaine.