Les systèmes de culture continue en bioréacteurs restent, malgré leur intérêt indéniable, peu utilisés dans les laboratoires de microbiologie. L’objectif de ce doctorat est de faciliter leur mise en œuvre en proposant un nouveau système modulaire de mini-bioréacteurs pilotés par ordinateur en s’appuyant sur les opportunités offertes par l’essor des technologies de fabrication numérique et des microcontrôleurs programmables. Les volumes de culture visés sont de 5 à 10 mL afin d’assurer une utilisation limitée de milieu de culture tout en assurant une diversité génétique suffisante pour des expériences d’évolution. Cette taille de réacteur permet d’envisager des plans d’expériences complexes pouvant impliquer de nombreux bioréacteurs (en parallèle, en cascade, avec suivi et contrôle en temps réel, …). Comme preuves de concept, plusieurs applications, principalement chez la bactérie à Gram-positif Bacillus subtilis, ont été réalisées dans des contextes d’évolution expérimentale et dirigée.