Le microbiote intestinal joue un rôle central dans le maintien de la santé humaine, assurant des fonctions essentielles de protection contre les pathogènes, de régulation immunitaire et de métabolisme. Sa perturbation, ou dysbiose, est aujourd’hui reconnue comme un facteur clé dans le développement de nombreuses pathologies. Les infections à Clostridioides difficile (C. difficile) en constituent un exemple particulièrement frappant : ce pathogène nosocomial majeur profite précisément de la dysbiose induite par les traitements antibiotiques pour s’installer et provoquer des infections récurrentes. Le défi thérapeutique est d’autant plus complexe que les antibiotiques, tout en constituant le traitement de référence, entretiennent paradoxalement la dysbiose qui favorise ces rechutes.

C’est dans ce contexte que j’ai initié au sein de l’unité MICALIS une thématique centrée sur l’utilisation de bifidobactéries comme alternative probiotique ciblant ce pathogène. Les projets menés dans ce cadre ont permis la mise en place d’un pipeline intégré allant de la sélection et la caractérisation approfondie des souches jusqu’à leur évaluation dans des modèles précliniques, et d’établir une preuve de concept solide de leur activité anti-C. difficile. Mes projets futurs visent à élargir cette approche en étendant la diversité des souches étudiées, en intégrant un volet immunologique sur modèles cellulaires et en validant les candidats les plus prometteurs dans des modèles murins de rechute.